Los residuos y desechos vertidos al mar es otro de los problemas que afectan la subsistencia de las tortugas marinas. Es un hecho bastante divulgado que las tortugas confunden las bolsas de plástico con las medusas, una criatura que forma parte fundamental en sus dieta. En el Centro de Rehabilitación también han atendido a tortugas que se encuentran gravemente heridas por barcos pesqueros.
En la temporada de anidación correspondiente al período 2019-2020, a lo largo de 77 kilómetros de costa ecuatoriana, en 41 playas de anidación se censaron 1.216 nidos de tortugas marinas de las especies golfina, verde y carey.
De igual manera, en las provincias de Esmeraldas, Manabí, Santa Elena, Guayas y Galápagos, el ejecutivo del país ecuatorial tiene 21 áreas dedicadas a la protección de las tortugas.